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后期管理控制温度在22—28 空气相对湿度在90%—95%，每天浇水一次，做到湿而不见水，忌长时期积水，同时做好通风管理，灵芝原基生长迅速，日生长速度可达0.5-1cm，边缘向外扩展，形成菌盖，菌盖边缘乳白色，菌盖一圈圈向外扩散生长。采收经过20d左右，灵芝菌盖边缘乳白色-乳黄色圈消失，菌盖开始革质化，呈棕色，表明菌盖已停止生长，但还可进行加厚生长。菌盖下面子实层内弹射出棕红色担孢子时，表明子实体已成熟，即可采收。采收时用锋利的小刀或果技剪在菌柄0.5-1cm处割取。采收后的子实体应及时晒干或烘干，然后装袋入库储藏。
入土排场管理场地选择背风、水源好、日照短的场所，搭好遮阴棚，高度要求2米以上，阴度要求五分阴五分阳，四周开排水沟，中间开厢，厢宽2.5米，长不限，厢与厢之间留30厘米人行道，把移到芝场已长好的筒料外袋撕掉，并排紧靠人行道两旁，然后用地膜覆盖防雨，在地膜上撒上细土，以不见地膜为宜，4~5天后扒开细土，撕开地膜，观察菌丝已恢复，并且相互连接时，即可把地膜全部取走，盖上细土，土高出筒料2厘米，上面撒上树枝、树叶等，此后经常喷水保湿，当气温升至18~24°C时会大量现蕾，此时可根据需要，摘除太密的菌蕾，以防灵芝开伞时形成连体芝。如需要制作特大灵芝，可加厚覆土，在需要长芝的地方让菌筒小面积裸露，用草木灰水喷洒这个部位，进行定点刺激、定点出菇，如在这个部分出现多个芝柄，即可以除小留大，选无虫害的一个芝柄。制作一个特大灵芝需要做好预算：“长脚紫芝07-6”每百公斤柴种一年可产五年，年可产1公斤干品，第二年可产2公斤干品，第三年可产1.5公斤干品，第四年可产1公斤干品，第五年可产0.5公斤干品。如果想入土当年制作一个5公斤重的灵芝，则一定要放足500公斤菌材。如果想制作更大的灵芝，那么就要考虑配方上的生物素的加足量。灵芝是，所以整个制作过程中不能用多菌灵、敌敌畏等含硫物质。如果灵芝出现害虫，可用紫外线灯于夜间灭杀，每晚灭杀4个小时即可，每50平方米放上一支紫外线灯。如菌体上已经出现害虫，那就只能用手工捉杀，或摘除出售。
超临界提取法．超临界提取法利用气体在超临界状态下的性质,即流体的性质，使有效成分被流体萃取,Li等M运用超临界CO2萃取技术提取灵芝抱子，萃取率达到37%．机械法机械法的优点是操作简单、易行;缺点是机械设备投资大、运行成本较高．碾压、挤压法．在低温等条件下，利用罐体和球磨等的迅速摆动、碾磨、挤压将灵芝抱子破壁．利用高能纳米冲击磨对灵芝抱子进行破壁处理，灵芝抱子的破壁率在80%以上，且能有效解决黏球、黏壁现象．高压气爆法．高压气爆法通过在某一时间内将未破壁的灵芝抱子维持在高压力的状态中，然后在另一时间内泄压至较低压力，使灵芝抱子细胞壁上的孔穴增大和增多．例如，刘东波等运用高压气爆法处理灵芝抱子样品后，灵芝多糖和三萜提取率有较大提高． 气流粉碎法．
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